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Voir un BED fichier en ligne, gratuit

Visualiser et formater des fichiers .BED en ligne. Mise en forme (pretty-print), recherche et exploration des données sous forme de tableau ou d'arborescence, gratuitement.

Déposez votre fichier .BED ici

Ouvre votre fichier .BED ici même.

Choisir un fichier
Jusqu'à 50 Mo · JSON, XML, YAML, TOML, INI
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Sans inscription. Ouvrez-le simplement
100 % gratuit. Aucune limite d'utilisation

Comment ouvrir un fichier JSON en ligne

Trois étapes, quelques secondes, aucun logiciel.

01

Ouvrez votre fichier .BED

Déposez-le dans la zone, choisissez-le sur votre appareil ou collez directement les données.

02

Voir la structure

Votre fichier .BED s'ouvre sous forme d'arborescence ordonnée et pliable, avec l'indication précise de la ligne en cas d'erreur.

03

Rechercher, copier ou télécharger

Recherchez des clés et des valeurs, copiez n'importe quel chemin ou valeur, passez à un tableau ou téléchargez une copie propre.

Qu'est-ce qu'un fichier .BED ?

Le format de données le plus courant sur le web.

Un fichier BED est un fichier Browser Extensible Data - un format texte brut délimité par des tabulations qui stocke les coordonnées chromosomiques pour des caractéristiques génomiques telles que les gènes, les pics ChIP-seq ou les éléments répétés. Ouvrez-le dans IGV ou l'UCSC Genome Browser pour le visualiser, ou dans n'importe quel éditeur de texte pour inspecter les données brutes. Le format est en texte brut et ne contient aucun code exécutable.

Programmes qui ouvrent les fichiers .BED

Windows
Notepad, IGV (Integrative Genomics Viewer), Integrated Genome Browser (IGB)
macOS
IGV (Integrative Genomics Viewer), Integrated Genome Browser (IGB)
Linux
bedtools, IGV (Integrative Genomics Viewer), Integrated Genome Browser (IGB)
Web
Ensembl Custom Tracks, UCSC Genome Browser
Détails du format .BED
Nom completBrowser Extensible Data
DéveloppeurUCSC (University of California, Santa Cruz) Genome Bioinformatics Group
Première versionlate 1990s, UCSC Genome Browser project; GA4GH BED v1.0 formal spec published 2021
CatégorieTexte & Code
Type MIMEtext/plain

Visionneuses associées

Chaque visionneuse est gratuite.

Foire aux questions

Mon fichier .BED est-il téléversé quelque part ?

Non. Le fichier est ouvert directement à partir de la copie que vous choisissez.

Mon fichier .BED est invalide. Pouvez-vous le réparer ?

Nous indiquons la ligne et la colonne exactes de la première erreur. Pour les problèmes courants comme les commentaires, les virgules traînantes, les guillemets simples ou les True/False/None de style Python, cliquez sur Tenter de réparer et téléchargez le fichier corrigé.

Quelle taille peut faire le fichier ?

Jusqu'à 50 Mo. L'arborescence ne construit que les branches que vous ouvrez, ainsi même les fichiers de plusieurs mégaoctets restent réactifs.

Qu'est-ce que JSONPath ?

Un chemin comme $.orders[3].customer.email qui pointe vers une valeur à l'intérieur des données. Cliquez sur n'importe quel nœud pour voir son chemin et le copier pour du code, jq ou votre documentation API.

Puis-je voir mes données sous forme de tableau ?

Oui. Tout tableau d'objets peut être affiché dans la Tableau vue et téléchargé au format CSV.

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